Зоинкс! Две години след като "Мистерия ООД" затваря врати, Скуби-Ду и неговите помощници в разкриването на престъпления Фред (Фреди Принц Мл.), Дафни (Сара Мишел Гелар), Шаги (Матю Лилърд) и Велма (Линда Карделини) са поканени на Призрачния остров, за да разследват порезица от паранормални инциденти в ултра-модерния курорт. Разтревожен, че популярният курорт наистина е завладян от духове, собственикът на Призрачния остров, Емил Мондавариус (Роуън Аткинсън) се опитва да събере отново прочутия детективски екип, за да разреши свръхестествените загадки, преди всички посетители да са избягали от страх. Скуби и цялата банда трябва да преодолеят противоречията си, да забравят всичко за фалшивите призраци и измамите с духове... и да разкрият мистерията.